葉綠素a本身對環境沒有危害，但它是估算浮游植物生物量的重要指標，可以通過測定水中浮游植物葉綠素a的含量，掌握水體的初級生產力情況和富營養化水平，在環境監測中，葉綠素a含量(liang)是評價水體富(fu)營養化(hua)的指標之一。

中國環境科學研究院李(li)子成在《中國湖庫營養現狀調查分析(xi)》中對(dui)湖泊、水庫的營養狀態進行(xing)了分級：

比較國(guo)內外標準中葉綠素(su)a測定(ding)的關鍵(jian)步驟在(zai)于：提取試劑、濾膜(mo)類(lei)型、樣品保存方法、是(shi)否研磨機研磨后(hou)是(shi)否需要浸泡、計算方法。

1.提取試劑

除熱乙醇法，國內外標準方法均采用90%丙酮作為提取試劑。EPA446.0指出，90%丙酮溶液可以有效提取大部分藻類細胞中的葉綠素a，而且不產生其他衍生物。丙酮是國際上較為公認的提取葉綠素的試劑

2.濾膜

除《水和廢水檢測分析方法（第四版）》采用乙酸纖維濾膜外，均采用玻璃纖維濾膜。

3.樣品保存方法

樣品的保存條件各種方法略有不同，但水樣采集后均保證4℃冷藏保存，樣品濾膜可冷凍保存。而且葉綠素a測定樣品濾膜冷凍后再研磨，可提高提取效率。暨南大學水生生物研究所的林少君在《浮游植物中葉綠素a提取方法的比較與改進》的研究結果。如采樣后不立刻測定，-18℃下冰凍，再于室溫條件下融解，利用細胞內冰粒的形成和細胞液濃度的增高引起溶漲，使胞壁結構破碎引起葉綠素溶出。

4.是否研磨及研磨后是否需要浸泡

雖然研磨的方法較為費力，但是該方法操作簡單，儀器設備要求低，常溫操作不會對葉綠素a造成破壞，細胞破碎完全，對葉綠素的提取速度快，效率高，并在環境監測系統廣泛應用，考慮到方法的經典性和數據的可沿用性，新的技術線路中關于對葉綠素a的提取步驟沿用《水和廢水監測分析方法（第四版）》中的研磨方法，研磨提取葉綠素a，主要通過機械作用破壞藻類的細胞壁和葉綠體使葉綠素a溶解于丙酮，并在此基礎上進行改進。

5.計算公式及波長

關于計算方法，主要有三色法和單色法，三色法主要考慮了葉綠素b和葉綠素c對測定的干擾，測定的是表觀葉綠素a的含量（包括葉綠素a與脫鎂葉綠素a之和），單色法考慮脫鎂葉綠素a的干擾。從方法的簡便性來說，三色法操作簡單，產生誤差幾率小，耗時比單色法短；目前《水和廢水監測分析方法（第四版）》中測定葉綠素a的方法在地表水環境監測中應用最為廣泛，該方法采用丙酮研磨提取葉綠素a，用三色法計算葉綠素a的濃度。